肿瘤NGS基因检测解析,您的疑问,这里都有答案(样本采集篇)

2024.04.30 责任编辑:陈醒 阅读量:58

在精准医疗的新时代,肿瘤NGS基因检测已成为肿瘤诊断和治疗的重要工具。它通过深入分析肿瘤的基因特征,为患者提供个性化的治疗方案。然而,面对这一高科技检测手段,许多人仍然存在诸多疑问。本文将续接上期肿瘤NGS基因检测全解析(基础知识篇),带您了解肿瘤NGS基因检测样本采集的相关知识,解答常见的问题,让我们一起探索肿瘤NGS基因检测的世界,为您的健康之旅导航。

Q1.肿瘤基因检测,新鲜组织、石蜡切片、胸腹水、外周血样本类型怎么选择?
毋庸置疑,组织应该是金标准,有组织的情况下,肯定组织优先。
对于初次检测,有组织样本的,优选组织样本;如无组织样本,可以送检胸水、腹水、血液等样本。
对于复发、转移或耐药患者,可以根据具体情况,送检穿刺组织、胸水、腹水、脑脊液、血液等样本。
按照检出率:新鲜组织>石蜡切片>胸腹水>外周血。
做肿瘤基因检测,还需要考虑临床取样的便捷性。
按照采样便利性:血液>石蜡切片>胸腹水>新鲜组织。

Q2.选择组织样本注意事项 
1)对于未接受过靶向/免疫药物治疗的患者,NGS检测应首选经病理评估的组织样本,优先使用手术切除样本,也可选择活检样本(选择肿瘤含量最高或肿瘤最集中部位)。
2)接受过靶向/免疫药物治疗的患者,应尽可能使用治疗后的样本,以寻找治疗后新出现的耐药突变。

Q3.选择蜡块样本的注意事项
建议使用一年内的蜡块,因蜡块中的核酸会随时间降解,特别是脂肪含量高的组织,如乳腺、胃、结直肠样本,由于前期脱水不足,可能加速降解。而且患者的基因变异情况也可能因疾病进程和治疗的变化而改变,过长时间保存的样本可能无法真实反映患者当前的基因变异情况,对于临床指导的意义有限。

Q4.选择蜡卷/切片时注意事项
在制备蜡卷或切片时,应注意每次更换新的刀片或刀口,并对切片机和台面进行清洁,防止交叉污染。蜡卷应装入干净的离心管中。在捞片时,要保证水面的清洁,避免交叉污染。如需同时进行免疫组化(IHC)和荧光原位杂交(FISH)等在载玻片上开展的项目,请务必选择防脱载玻片(黏附片),切片厚度5μm为宜,无需烤片处理。

Q5.什么时候适合选择外周血进行检测?
1)对于无法获取(足量)组织的晚期患者(临床Ⅲ期后),建议在治疗前或治疗后临床确认耐药进展或复发后采集血液样本。
2)外周血ctDNA检测最好是在没有经过任何治疗之前进行采血检测,放化疗和靶向治疗均会对外周血ctDNA检测结果产生影响。

Q6.胸水可以作为检测样本吗?
可以。接收标准如下:
1)肿瘤细胞含量不能低于20%。
2)送胸水离心后的浓缩液,不能超过20 毫升。
3)最好做成蜡块,以便病理质控。

Q7.组织保存液如何使用?
组织保存液常温保存常温寄送即可,新鲜组织可以在组织保存液中保存至少一个月。

Q8.组织样本时间要求?
一年内的肿瘤组织样本。

Q9.以前的原发灶标本和近期转移灶标本,应该送哪个样本进行检测?
按照样本质量,建议优先选择近期转移灶标本。如条件允许,建议原发灶标本和转移灶标本同时送检(但需要按照2份标本进行收费),以便进行基因变异图谱比较,以解决组织异质性的问题。

Q10.一位肿瘤患者发生转移且目前状态较差,应该使用肿瘤组织还是外周血进行基因检测?
有一年内的肿瘤组织建议送组织,因一年以上的肿瘤组织有可能DNA降解,无法检测或者检测失败。如果没有一年内的肿瘤组织,就送外周血进行检测。需要注意的是,外周血检测建议只针对IIIB和IV期的患者。

Q11.患者使用过骨扫描注射氟影像剂,采集对照血时是否会对后续实验、分析有影响?
不影响,可正常采集患者的对照血。

Q12.患者注射过脂肪乳,血液呈现乳白色,能否采集外周血进行ctDNA检测?
可尝试采集外周血进行检测,但存在一定检测失败风险。在送检单上必须注明患者输过脂肪乳以及注射时间等信息。

Q13.胆囊癌患者前几天输了白蛋白,做了增强CT,对用药检测有影响吗?
增强CT是临床常用的检测手段。根据目前检测经验,对基因检测的影响不大。
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DNA鉴定

根据孟德尔遗传定律(亲子鉴定的理论基础),孩子身上的遗传物质一半来自于生物学父亲(简称“生父”),一半来自于生物学母亲(简称“生母”),每个基因座上的两个等位基因也分别来自生父和生母。DNA亲子鉴定就是根据科学技术将子女的DNA信息与父亲、母亲的DNA信息相比对,如果符合即是亲生关系,不符则非亲生。

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